Ngoài việc xử lý kỷ luật cá nhân liên quan vụ việc, Trường TH-THCS-THPT Phan Chu Trinh cũng phải chịu mọi chi phí phát sinh trong quá trình tổ chức thi lại cho khoảng 20.000 học sinh lớp 9.