Nhiều lãnh đạo chủ chốt của doanh nghiệp này giai đoạn 2012 – 2013 đã thực hiện hợp đồng xuất khẩu gạo và mua bán gạo không đúng quy định, gây thiệt hại cho doanh nghiệp hàng trăm tỷ đồng.