Theo Bộ Giao thông Vân tải (GTVT), khu vực ga Hà Nội và phụ cận là trung tâm cửa ngõ giao thông quan trọng của Thủ đô. Vì vậy Đồ án cần có sự so sánh đối chiếu cụ thể các chỉ tiêu và các tác động với quy hoạch chung của Hà Nội.
Do quy hoạch nhà cao tầng xung quanh ga Hà Nội trái với quy định hiện hành, thành phố sẽ xin ý kiến Thủ tướng về nội dung này.
Hà Nội đề xuất giữ nguyên trạng nhà ga Hà Nội, xung quanh ga quy hoạch nhiều cao ốc cho dân số khoảng 44.000 người.
Với ý tưởng xây dựng cao ốc từ 40-70 tầng, Hà Nội muốn hiện thực hóa khu vực ga Hà Nội trở thành trung tâm tài chính, kiến trúc, nghỉ dưỡng đô thị. Tuy nhiên, lãnh đạo Bộ Giao thông vận tải (GTVT) cho biết hiện chưa nhận được bất kỳ văn bản nào liên quan đến công trình này.