Mặc dù logo sử dụng tiếng Nhật và nhiều thông tin khác trên bao bì sản phẩm liên quan nhiều đến Nhật Bản nhưng phần lớn, hàng hóa tại chuỗi cửa hàng Miniso lại có nguồn gốc xuất xứ từ Trung Quốc. Chính logo và các thông tin này đã gây ra nhầm lẫn và sự hoang mang lớn cho người tiêu dùng khi đến mua hàng tại đây.

Miniso Việt Nam hiện được điều hành và quản lý từ đội ngũ nhân sự do Miniso Trung Quốc cử sang để thay thế vị trí bà Dương Thanh Tâm, người đưa Miniso về Việt Nam 2 năm trước.